2008年他们输给了湖人，2009年被小牛淘汰，2010年半决赛被太阳横扫，2011年遭到灰熊黑八，2012年被雷霆逆转，邓肯持续5年无缘插手总决赛。
2004-05赛季，马刺卷土重来。没有了湖人的挡道，马刺在西部鲜无敌手。他们别离击败了掘金、超音速和太阳，进军总决赛。总决赛中马刺和活塞鏖战7场，仰仗着邓肯中流砥柱般的感化以及吉诺比利神勇的阐扬，马刺终究击败了活塞。邓肯第三次被选总决赛MVP。
北京时候2016年7月11日，NBA闻名球星蒂姆-邓肯宣布退役，结束了长达19年的职业生涯。
2002-03赛季对于邓肯而言，是职业生涯的一次严峻转折。这个赛季，他身边多了一个叫吉诺比利的队友，马刺有了GDP组合；同时，这一年他持续第二年被选了联盟MVP；而他的老火伴罗宾逊，则步入了生涯的最后年初。在季后赛次轮，马刺再次碰到了OK组合领衔的湖人，此次，邓肯没有再让胜利旁落，他场均获得28.0分11.8篮板4.8助攻，马刺以4:2击败湖人挺进西部决赛。跟着马刺持续击败小牛和篮网，邓肯拿到了生涯第二座总冠军奖杯，并加冕了FMVP。
2003-04赛季，邓肯带领马刺一起顺风顺水打到了西部半决赛。他们的敌手又是湖人。两边前四场战成了2:2平，然后在关头的天王山之战，费舍尔0.4秒不成思议的绝杀球，完整窜改了全部战局。终究，邓肯收成了失利的结局。但是，湖人总决赛惨败给活塞，球队内部冲突发作，OK组合崩溃。
2013-14赛季，马刺再一次揭示了他们的强大之处，他们又一次杀进总决赛，并且以4:1轻取热火，完美地实现了复仇打算。这是邓肯的第五座总冠军奖杯。
合法人们觉得邓肯即将谢幕的时候，马刺却在2012-13赛季再次闯进了总决赛，并且，过程出人料想的轻松。总决赛面对具有三巨擘的热火，马刺在3:2抢先的环境下，并且G6胜利几近到手的环境下，再次成为了背景：雷-阿伦最后0.9秒的三分球挽救了热火，并成绩了邓肯生涯独一一次总决赛得胜。
邓肯是1997年的状元秀。在选秀之前，邓肯作为公认的状元热点，激发了马刺和凯尔特人的摆烂暗战，终究马刺运气更好，收成了这位球员。刚入马刺的邓肯，与传奇中锋大卫-罗宾逊成为了队友。邓肯和水兵大将，成为了马刺可骇的双塔组合。他们合作的首个赛季，马刺56胜26负，在季后赛第二轮不敌爵士。
2006-07赛季，总决赛上碰到了小天子带领的骑士军团，成果邓肯戴亮马刺以4-0横扫敌手，让小天子直到现在也还是总决赛0胜的处子男，让小天子现落空了冠军梦，他在联盟中的职位也因为没有总冠军而一向被科比给压抑住。那年的总决赛MVP授予给了法国人帕克，但是马刺真正的中流砥柱，王朝的绝对核心是站在帕克身后，度量着女儿浅笑地看着帕克的“石佛”邓肯。从1997年以状元身份进入NBA后，邓肯四次杀进总决赛，四次都终究完成终究任务，带领马刺封王。第四次杀进总决赛，邓肯已经谈笑风云，他的数据仍然仍然不那么刺眼，前三战均匀进献22.7分11.3篮板3.16盖帽以及3.3助攻，最后一场12分15篮板3助攻2盖帽2抢断，一样是全能的表示。石佛从进入联盟到06-07赛季，已经走过了十年的江湖生涯，终究在2007年夏天建成他统治下的马刺王朝。从1999年关结黑八传奇的笑傲江湖，到2007年与小天子在总决赛上的谈笑风云，四次总决赛班师的邓肯已经超出了巨大。